350 件の論文
進化生物学は、生命がどのように時間とともに変化し、多様な姿を形成してきたかを解き明かす分野です。遺伝子の働きから種間の関係まで、過去の証拠と現在の観察を結びつけることで、私たちの存在のルーツに迫ります。
Gist.Science は、bioRxiv から投稿される進化生物学の新しいプレプリントをすべて収集し、専門用語を噛み砕いた解説と、技術的な詳細をまとめた要約の両方をご用意しています。これにより、専門家だけでなく広く一般の方々が、最先端の研究成果をスムーズに理解できます。
以下に、進化生物学の最新プレプリントの一覧をご紹介します。
本研究は、定量的遺伝モデルと生態・進化フィードバックを統合することにより、緩やかな環境変化下における個体群の存続には双安定性が存在し、すなわち、初期の個体群サイズおよび遺伝的分散が一時的な動態を克服するのに不十分な場合には、臨界変化率を下回る状況であっても絶滅が起こり得ることを示している。
本論文は、深層シーケンシングを活用して4桁のオーダーにわたる適応統計を解明し、進化する集団における突然変異誘発アレルや誘導性突然変異といった明確に異なる適応メカニズムの直接的な定量化および識別を可能にする、DNAバーコード化されたルリア・デルブリュック・アッセイであるHiDenSeqを導入するものである。
ProtFinderは、転移学習に基づく新しい機械学習フレームワークであり、実際のデータセットにおけるタンパク質置換モデル、速度不均一性モデル、および頻度モデルの選択において、既存の手法を精度と速度の両面で大幅に上回ります。
本研究は、オス特異的なDoublesex転写因子のパラログであるDsxMが、胚の眼形成領域を拡大させることで、保存された網膜決定遺伝子ネットワークを再展開し、新たなオス特異的視覚系を発達させることで、カゲロウのTurbEyesの進化的な起源を駆動していることを明らかにしている。
Flex-sweep 2.0は、単一集団のゲノムデータから多様な選択一掃（セレクティブ・スイープ）を検出するために、計算効率、柔軟性、およびスケーラビリティを大幅に向上させ、かつ強化された学習機能と堅牢なダウンストリーム解析パイプラインを提供する、CNNベースの実質的に更新された手法である。
本論文は、複雑な進化史を正確に推論するために、系統ネットワークツールであるSnappNetと近似ベイズ計算ランダムフォレストを組み合わせたハイブリッド手法「Snarf」を導入するものであり、これを適用することで、アジアイの家畜化はジャポニカ型の単一の起源と、それに続くインディカ型、cAus型、およびcBas型を形成した3つの主要な遺伝子浸透イベントを伴うものであったことを明らかにした。
本研究は、減数分裂特異的なヒストンメチル基転移酵素であるPRDM9が、安定したG-四重鎖DNA構造を直接認識して結合することを実証しており、これらの二次構造がPRDM9の動員と減数分裂における組換えの開始を促進するという新たなメカニズムを明らかにしている。
本論文は、個人の選好のダーウィン的進化が社会集団をより効率的な集団戦略へと導き得る一方で、この改善の成否と速度は、個人の選好が集団の意思決定へとどのように集約されるかに決定的に依存しており、さもなくば停滞や不適応な結果を招きかねないことを示すモデルを提示するものである。
この研究は、鳥類のさえずりの複雑さにおける世界的な変異が、性選択や知性のシグナルといった従来の説ではなく、学習能力、開放的な生息地や渡りといった生態学的要因、そして進化の歴史の相互作用によって主に引き起こされていることを明らかにしている。
本研究は、全ゲノム解析を用いることで、シャクガ科の一属である*Parasa*（およびその複合種）の熱帯全域における分布が、分断によるものではなく、中新世におけるアフリカを起源とした急速な長距離分散によって駆動されたことを明らかにし、同時に、同属が単系統ではなく大幅な分類学的再検討を必要とすることも示している。